发酵饲料源于新鲜原料的一种贮存方法，如反刍动物的青贮。近年，饲料资源日益短缺，非常规饲料资源利用的开发利用变得有利可图。经过发酵，原料固有的营养品质得到改善，同时会生成一些全新的功能性物质。

非常规饲料原料通常指农产品加工产生的废渣，如高纤维素、营养抑制因子的杂粕类，玉米与小麦副产物等。目前应用较多的是发酵豆粕、发酵棉籽粕等，目的重在消除蛋白酶抑制剂、非淀粉糖等抗营养因子，同时破解植物细胞壁。发酵麦麸、豆渣、米糠等，重在破解植物细胞壁，提高动物的适口性与能量利用。

发酵饲料制作，以下方面是确保成功的基础。

原料，一种或多种原料混合发酵，需要基质中有适宜的碳氮比，以细菌或酵母菌发酵时的碳氮比为5。基质含水率50-60%。原料不经过灭菌处理，力求杂菌含量较少。

菌种选择。蛋白原料发酵多选择芽孢杆菌、一些霉菌和乳酸菌。淀粉、纤维原料发酵多选择酵母和乳酸菌。生产上往往选取复合菌种，初期以有氧发酵为主，后期随氧气的减少而转为无氧发酵。微生物的产物以有机酸为主，而不是酒精。

发酵管理。固体发酵，重点是温、湿度管理。以前期有氧发酵时，传统塑膜密封的厌氧发酵，物料拌湿拌匀接种后，直接装入密封的容器内，发酵二三天，工艺简便，设施设备投资少，生产成本低，发酵时间取决于环境温度，以乳酸菌发酵为主，呼吸阀袋内发酵，原料拌湿接种后，直接装入呼吸袋包装袋中，热合封口后发酵，饲料在发酵初期好氧菌大量繁殖，产气激烈，气体通过呼吸阀排出，袋内氧气耗尽时，呼吸阀停止排气，厌氧菌开始繁殖，pH值达到4.0～4.5时微生物停止生长，发酵成熟，呼吸阀袋内发酵生产效率高，依靠产品pH调节后发酵程度。槽式翻料发酵，物料加水拌湿接种后，装入槽式发酵池，根据发酵温度进行机械翻料，物料发酵程度的可控度好，兼顾多种微生物的生长繁殖，代谢产物丰富，发酵效果好，但生产效率较低，发酵成本较高，应用效果也优于前两种。