玉米丝黑穗病是苗期侵入的系统性侵染病害，一般在穗期表现典型症状，主要为害玉米的雄穗和雌穗，一旦发病，通常全株没有产量。受害严重的植株苗期也可表现症状，分蘖增多呈丛生型，植株明显矮化，节间缩短，叶片颜色暗绿挺直，有的品种叶片上出现与叶脉平行的黄白色条斑，有的幼苗心叶紧紧卷在一起弯曲成鞭状。成株期病穗分两种类型：（1）黑穗型：感病雌穗比健穗短，下部膨大，顶部较尖，多不吐花丝，除苞叶和穗轴外全部变成黑褐色粉末，中间夹杂黑色丝状物；（2）畸形变态型：感病雄穗花器变形，花序变黑，不形成雄蕊，颖片变长呈叶片状。该病害容易在冷凉地区发病，玉米连作时间长、播种后土壤干旱、温度低、玉米出苗缓慢均有利于该病的发生。

提前预防是控制该病害的关键。在发病较重的地区，选用抗病品种，适时抢墒播种，合理轮作倒茬；为防止种子带菌传播，播种前应做好种子包衣，可选用2%戊唑醇可湿性粉剂，或15%三唑酮可湿性粉剂按种子重量0.4%-0.6%拌种；在发病早期应及时拔除病株，对苗期表现症状的应结合间苗拔除，显症后需在病穗白膜末破裂前拔除病株，并带至田外深埋或烧毁，防止越冬孢子散落增加来年的病原基数。